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  • 河南省郑州市中原区
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  • 条件:提供代码。生物信息分析绘图,绘制BSA性状定位分析过程的曼哈顿结果图。需求描述:默认选择1Mb为窗口,1kb为步长,计算每个窗口中SNP-index的平均值来反应子代的SNP-index分布。不能简单以单个snp来作图的。而且最后要有
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  • 目前在研究一个假基因的调控功能(假基因可编码RNA但是不能编码蛋白),想知道是不是非编码RNA在发挥作用,求问有没有网站或者软件可预测这个已知基因的非编码RNA?
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  • 请问怎么从GEO数据库获取的GPL基因注释文件中提取lncRNA的部分呢?尝试从GENCODE网站下载全部lncRNA的信息用ensembl号进行对应,但能筛选出的lncRNA很少且不全,请问各位大神,有什么其他办法能筛选出lncRNA呢?还是利用ensembl号对应
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  • 我需要下载human和mouse的全部SNP数据做后续分析用,看了dbSNP 的FTP有资源,但是不太懂应该要下载哪部分,该怎么下载。我是做分子的,不会写程序,也不太懂语言专业术语,请问还有救么。。。这个任务该怎么完成,求大神们指
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  • Table 1 Four lncRNAs were significantly associated with the CC survival in the test data set:Gnene symbole Coefficient Hazard ratio P value cox P value permutationAATBC 0.7521141 0.471369 6.69E-04 0.0004NCK1-AS1 1.0531199 2.8665807 3.25E-05
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  • 我想请教一下数据该怎么进行分析,我的实验分组是4个分组,分别为对照组,对照+刺激组,损伤组,损伤+刺激组,每组三个样本进行了质谱分析,现在想分析表达量有差异的蛋白,想我这样的情况该怎么分析,如何利用我的对
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  • 样品B7、B8是2个人的血液样品二代测序的结果,需要进行SNP/INDEL的鉴定(germline variants),并尝试分析二者遗传差异。求大神给个参考流程,或推荐几个相关的论文等
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  • 请问如何查找某基因的保守序列。我现在需要5SrDNA基因的保守序列,在NCBI上-Nucleiotide搜索框中输入5SrDAN,出来的都是5SrRNA, 由于RNA基因也会有内含子和外显子,所以搜出来的结果怎么运用,谢谢了,拜托拜托!!
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  • 我们研究转座子,如HERV,用临床标本进行RNA-seq,再经过分析后发现,HERVK-int表达是有差异的,但是这个命名与常见命名(ERVK-1,ERVK3-1等)不一样,请问是为什么??能否找出HERVK-int的碱基序列呢?
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  • uniprot使用求助
  • 北京市东城区东华门街道
  • 10.00
  • 诚意金悬赏
  • 485人参与 | 3人投稿
  •   已结束
  • 各位大神,请问uniprot里面检索蛋白,哪一部分是看蛋白质结构域?想看与目标蛋白相互作用的蛋白,在Interaction部分是看Subunit structure还是Binary interactions?以蛋白质RAP1A_HUMAN为例,能否举个例子演示一下?
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  • 想看某细菌的表面蛋白是否可结合DNA(非特异性DNA片段),并想知道是否蛋白质存在某特异位点与DNA结合,用什么方法?
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  • 求助一下大家转录组测序结果是不是都需要经过RT-PCR进行验证才能进行数据分析,或者只是为了加强转录组测序结果的可靠性?
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  • SEER数据库求助
  • 湖南省长沙市天心区
  • 10.00
  • 诚意金悬赏
  • 431人参与 | 2人投稿
  •   已结束
  • 最近看到一篇发表在JAMA Oncology上的文章,作者通过挖掘SEER数据库研究了初次诊断为乳腺癌脑转移的发病率和预后。我想把这种思路用在另外一种癌的肝转移上,在导出SEER数据的时候遇到了困难。我应该如何操作才能导出患者肿
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  • SEER数据库求助
  • 广东省广州市越秀区
  • 10.00
  • 诚意金悬赏
  • 376人参与 | 2人投稿
  •   已结束
  • 最近看到一篇发表在JAMA Oncology上的文章,作者通过挖掘SEER数据库研究了初次诊断为乳腺癌脑转移的发病率和预后。我想把这种思路用在另外一种癌的肝转移上,在导出SEER数据的时候遇到了困难。我应该如何操作才能导出患者肿
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  • 有两个问题,1. DAVID分析用Gene ID Conversion Tool将基因名字转变成DAVID ID是我输入了150个基因,为什么转换后只有146个ID?2.为什么在Functional Annotation Chart里面有一些基因are not in the output呢?望大侠不吝指教!
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  • 请教大家一个问题,我在TCGA下载数据的时候得到的临床数据是537例,提取RNA序列得到的case是530例,files是611例,运行后得到tumor count 是539例,normal count是72例[捂脸]第一次用。搞不清这些数据的关系。求教这些数据的关系?
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  • 如题,我进行了蛋白序列比对。看不懂这个图,还有就是我怎么看氨基酸保守序列有哪些。
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显示 1~20 项 共 113 个需求
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