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  • Initial bases on target 656973 Average sequencing depth on target 2164.4 Fraction of effective bases on target 10.44% Effective bases on target(Mb) 1421.95 Total effective bases(Mb) 13613.91 Fraction of mapped reads on target(include dups) 39.72% Mapped reads on targets(M) 118.38 Total mapped
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  • GEO数据下载问题
  • 广东省广州市萝岗区
  • 10.00
  • 诚意金悬赏
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  •   已结束
  • 如果找到一个GEO数据信息,发现做了5种肿瘤的信息,包括乳腺癌,肺癌,前列腺癌等,我可以下载下来之后,从excel里只提取其中一种肿瘤下的数据集分析吗?每种肿瘤样本都做的有不同条件下的对照组和实验组。
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  • 看了一篇生信文献,其中介绍一个分析工具是“ Morpheus Website ”,原文说process in Morpheus Website with standard,在网上找了很久,找不到这个Morpheus Website,向各位神通广大的威客求助,帮忙找下这个分析网站,谢谢
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  • 分析的样本有分为癌症组和对照组,经过预处理后,画出了这样的图形,为啥两组会聚到一块呢?生信小白一枚,请教各位大神~样本是共有8个病人,分别取得肿瘤组织和癌旁组织,这个画出这样的图,是我的分析问题还是样本
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  • 小鼠皮肤做流式,需要破膜,因为约做流式的时间不固定,但是我们小鼠做放疗以后的3 7 10天必须处理皮肤组织,可是流式仪不一定约的到,是到那一天把皮肤组织先用多聚甲醛固定好,还是直接处理皮肤样本,将表面抗原标记
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  • 我最近在做某肿瘤和正常组织间的变异,如果我选了一个STR基因座上的一个单等位基因,计算出它们各自的频率,请问我应该选什么统计方法计算两组频率有没有差异以及选用这种统计方法的理由!
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  • 之前看文献里,有人用cbioportal查了某种蛋白upregulation之后的患者survival,如图,可是我打开该网站研究了半天也只能发现突变之类的数据,并没有上调的数据……请问各位大牛,有人知道怎么用这个网站查上调蛋白吗?感激不尽
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  • 我之前用荧光酶报告基因测试结果显示该mir的确是与某受体utr结合使荧光信号降低,突变回复荧光。但是在构建质粒,将utr构建到pmv6受体与flag融合蛋白终止密码子之后,flag抗体杂交western结果显示是没有变化的,请问这个结果合
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  • 生物美图
  • 河南省郑州市中原区
  • 10.00
  • 单人悬赏
  • 1372人参与 | 1人投稿
  •   冻结中
  • 条件:提供代码。生物信息分析绘图,绘制BSA性状定位分析过程的曼哈顿结果图。需求描述:默认选择1Mb为窗口,1kb为步长,计算每个窗口中SNP-index的平均值来反应子代的SNP-index分布。不能简单以单个snp来作图的。而且最后要有
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  • 目前在研究一个假基因的调控功能(假基因可编码RNA但是不能编码蛋白),想知道是不是非编码RNA在发挥作用,求问有没有网站或者软件可预测这个已知基因的非编码RNA?
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  • 请问怎么从GEO数据库获取的GPL基因注释文件中提取lncRNA的部分呢?尝试从GENCODE网站下载全部lncRNA的信息用ensembl号进行对应,但能筛选出的lncRNA很少且不全,请问各位大神,有什么其他办法能筛选出lncRNA呢?还是利用ensembl号对应
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  • 我需要下载human和mouse的全部SNP数据做后续分析用,看了dbSNP 的FTP有资源,但是不太懂应该要下载哪部分,该怎么下载。我是做分子的,不会写程序,也不太懂语言专业术语,请问还有救么。。。这个任务该怎么完成,求大神们指
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  • Table 1 Four lncRNAs were significantly associated with the CC survival in the test data set:Gnene symbole Coefficient Hazard ratio P value cox P value permutationAATBC 0.7521141 0.471369 6.69E-04 0.0004NCK1-AS1 1.0531199 2.8665807 3.25E-05
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  • 我想请教一下数据该怎么进行分析,我的实验分组是4个分组,分别为对照组,对照+刺激组,损伤组,损伤+刺激组,每组三个样本进行了质谱分析,现在想分析表达量有差异的蛋白,想我这样的情况该怎么分析,如何利用我的对
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  • 样品B7、B8是2个人的血液样品二代测序的结果,需要进行SNP/INDEL的鉴定(germline variants),并尝试分析二者遗传差异。求大神给个参考流程,或推荐几个相关的论文等
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显示 1~20 项 共 123 个需求
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