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  • 最近试了好多方法去搜索了很多pathway database, 想找FBW7基因的上下游及所在的pathway,都没有找到,在这里请求各位大神帮忙指导,万分感谢!!!
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  • 以前未接触过基因及生物信息这方面的实验,先需要做某一基因(如HAMP)的生物信息学,不知道如何开展,步骤是什么。查资料,又是提RNA,又是设计引物测序,又是根据峰图找突变位点,又是查SNP位点rs号,还有上传测序得rs号
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  • 本人因为发表文章投稿后专家建议使用SILVA数据库分析16SrRNA序列,就做简单的多序列比对和构建进化树,我进入网页后发现基本是一些说明, 所以不知道怎么使用数据库进行分析, 希望各位能给我解燃煤之急!
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  • 关于KEGG和GO问题
  • 北京市怀柔区九渡河镇
  • 12.00
  • 诚意金悬赏
  • 135人参与 | 3人投稿
  •   12天后投稿截止
  • 看其他人KEGG和GO分析中把一串基因list塞进去,得到一堆值,然后画画图,好像很轻松的样子。然而,本渣在操作的时候,却遇到了了一个基本的问题:放进去的基因list,也就是DEG,是所有的DEG都塞进去,还是分上调的和下调的分
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  • 请问一下,TCGA在Visualize Your Data 一栏中如何展示自己的数据?我发现请问一下,Visualize Your Data 基因突变类型只有CNV,infr ame,missense mutation,没有fr ameshift indel,splicing site?怎么显示fr ameshift indel, splicing site?而本身TCGA数据库自己的
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  • 我做iTRAQ的物种,之前没有人做过基因组和转录组,所以用的植物界总蛋白来鉴定可信蛋白的,也就是鉴定出的差异蛋白质都是其它物种的。因为我没找到和我情况类似的文献参考,所以不知如何撰写讨论呢,大家遇到过这种情况
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  • 关于肿瘤细胞和肿瘤微环境的研究GEO芯片,实验设计是:Tissue from five tumors were compared to corressponding microdissected tissue from the same tissue sample,不明白二者的区别在哪里。求大神指教!
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  • 最近分析数据需要用R做一个关于logistic回归的列线图,在网上和论坛里找了很多代码,套用总是出错。数据很简单就是糖尿病,高血压是二分类,其余是定量资料,代码如下:library(foreign)rt=read.table("senlintu.txt",header=T);rtlibrary(Hmis
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  • snp命名
  • 重庆市万州区龙驹镇
  • 10.00
  • 诚意金悬赏
  • 108人参与 | 3人投稿
  •   已结束
  • 1. g.101980394T>C;2. c.425A>G;3. p.His142Arg这是文献中给出的CHUK基因的三个突变点,可能是以HGVS命名的,我想要找他的另一种以“rs”号方式命名的表达,哪位前辈能够指点一下,不胜感激!
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  • 求大神赐教,现在有测序后全基因组的拷贝数的值和位置信息,想看一下出现CNV的位置是什么基因,有没有什么软件或者代码可以批量注释?
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  • 有一篇文章要用箱式图,数据是很简单的有sex hb bt三列数据,bt与sex是二分类变量,但在做两因子的箱式图时发现了X轴有问题,代码如下:rt=read.table("hb sex.txt",header = TRUE)rt$sex.f=factor(rt$sex,levels=c(0,1),labels=("male","female"))rt$bt.f=factor
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  • 通过生物信息学手段对功能未知基因1700121C10Rik进行基因编码区预测和进化树分析。在NCBI数据库中输入该基因名,只出来小鼠中该基因的基本信息,比如基因组中的位置和可能的转录本信息。对于该基因是否编码蛋白质并没有明确
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  • 请教下大家,在GSEA分析时,跳出错误显示As the phenotype choosen was continuous, only continuous class metrics are allow。这一句是什么原因,该如何解决?谢谢了!
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  • 求翻译,生物信息学方面lthough the authors improved the content and quality of the manusc ript, th ANOVA table is not presented yet. Since the authors conducted all experiments three times; this means , you have Experiment and Threatments are the main effects. Therefore, you will have Expe
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  • 请问大家用哪个软件可以做出这种火山图?如何根据差异蛋白fold change来标记不同颜色呢?
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  • 各位大神好,公司已经对转录组数据进行了分析,然而老师要我进行接下来的功能挖掘,我就有点无从下手。请问我需要怎么着手呢?是先看差异基因表达,之后KEGG的注释在找到这个基因通路么?GO的结果注释图怎么看,有点看
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  • 有两个问题:一是在GENCODE的基因注释文件中,我发现有些基因在旧的版本中出现,而在新的版本中被移除了,这是为什么呢?二是有些新版本的基因数比旧版本略少,这是什么原因呢?谢谢!
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  • 审稿人提出无参转录组的unigenes小于300bp的太多,让用CEGMA转件评估,请问大家这个需要怎么做?有没有具体的操作流程,谢谢!
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  • 各位大神好,请教下:下图中讲述通过GSEA富集分析后挑选Significant gene sets进行Cytoscape网络可视化,但是Cytoscape的使用需载入sif格式的文件,GSEA得到的结果是图片、总结表格,请问GSEA富集分析如何通过Cytoscape得到图2的图形?谢谢
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