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  • 下载了芯片注释文件,里面没有对应的gene symbol,竟然连GB、entrez gene id都没有了,只有下面几项,求问怎么样讲探针名转化为gene symbol,谢谢!#ID = transc ript_cluster_id#probeset_id =#seqname =#strand =#start =#stop =#total_probes =#gene_assignment =#mrna_a
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  • 下载了芯片注释文件,里面没有对应的gene symbol,竟然连GB、entrez gene id都没有了,只有下面几项,求问怎么样讲探针名转化为gene symbol,谢谢!#ID = transc ript_cluster_id#probeset_id =#seqname =#strand =#start =#stop =#total_probes =#gene_assignment =#mrna
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  • 请问分泌组学的质谱结果搜库得到蛋白后,怎么预测所得的蛋白是否为分泌蛋白呢?我在文献上看到一般是用Signal P 4.1预测经典分泌蛋白,用Secretome P 2.0预测肺经典分泌蛋白,有些文献还用TMHMM Server对跨膜结构进行预测,用ExoCar
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  • 我最仅做的课题需要搜集一些人类不同染色体上的同源序列(也可以是相似序列)。由于生物信息学知识缺乏,对NCBI数据库的应用能力也处于最初级的阶段。因此很是苦恼。看文献给了一个网址http://humanparalogy.gs.washington.edu/ 可以
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  • 想通过生物信息学预测lncRNA与靶基因的相关性,看一下是正调节还是负调节,请有关这方面的专家帮助一下。谢谢
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  • 已知一个酶的DNA序列想要知道一个酶的蛋白质结构和功能,对这个酶过表达其中的一段是不是对产量增加有意义?对DNA和酶的方面一点都不懂,想要知道从哪里入手,用什么软件进行分析。
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  • 各位大侠,请问是不是找出一个基因的保守区,其余的就是非保守区了?最近打算做CRISPR CAS9;但是我的基因是一个家族基因成员,我是不是要找出非保守区的序列 这样才能去设计gRNA呢?
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  • 想问各位大神blast能不能用hmmer建好的库做比对啊,我用hmmer建的数据库格式是.hmm,但是需要用blast比对,有办法实现吗?
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  • 如何防止蛋白降解
  • 上海市黄浦区半淞园路街道
  • 10.00
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  • 细胞在培养过程中,为了防止磷酸化的蛋白被降解需要加入什么试剂呢。求大神指教。
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  • 我想学习如何组装基因序列,但不知道从哪下手,用什么软件好,望有大神相助,我应该先去了解学习什么信息,如果能有一些组装过程,在这万分感谢
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  • 求助:GEO的芯片
  • 北京市顺义区仁和地区
  • 15.00
  • 诚意金悬赏
  • 292人参与 | 2人投稿
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  • GSE3467 中Overall design Total RNA was extracted from paired tumor and normal thyroid tissues from 9 PTC patients. The same set samples were applied to Custom miRNA microarray chips (OSU_CCC version 2.0) and Affymetrix HG-U133 plus 2 chips. 请问大神,为什么此芯片明确是研究miRNA,
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  • 请问各位大神,有人做过淋巴结转移癌的RNA-seq吗,新手上路,不知道淋巴结样本收集、提取是不是有什么技术难度,查文献很少看到这方面的研究。
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  • 初学R语言一些皮毛,加载gplots、RColorBrewer后,运行heatpap.2(data,...................)后得到图形,发现x轴标签文字竖直不好看,想旋转x标签文字30度,不知道如何操作,望前辈指导下。
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  • 刚接触生物信息学,在处理数据时候发现一个问题:在Affymetrix主页下载注释文件HG_U133A时候,预览文件可以见到探针ID、基因名称等项目,但是下载Affymetrix human gene 1.0 ST的注释文件后,预览文件项目中没有见到基因名称一栏(Aff
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  • 最近在学习limma的使用手册,作为一个生信小白看使用手册完全先看天书,有好多不懂的地方,有没有大神解惑一下,不胜感激。具体是这样的这几行代码适什么意思呢,我知道第三步是贝叶斯检验,但是贝叶斯检验是用来做什么
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  • 最近试了好多方法去搜索了很多pathway database, 想找FBW7基因的上下游及所在的pathway,都没有找到,在这里请求各位大神帮忙指导,万分感谢!!!
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  • 以前未接触过基因及生物信息这方面的实验,先需要做某一基因(如HAMP)的生物信息学,不知道如何开展,步骤是什么。查资料,又是提RNA,又是设计引物测序,又是根据峰图找突变位点,又是查SNP位点rs号,还有上传测序得rs号
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  • 本人因为发表文章投稿后专家建议使用SILVA数据库分析16SrRNA序列,就做简单的多序列比对和构建进化树,我进入网页后发现基本是一些说明, 所以不知道怎么使用数据库进行分析, 希望各位能给我解燃煤之急!
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  • 关于KEGG和GO问题
  • 北京市怀柔区九渡河镇
  • 12.00
  • 诚意金悬赏
  • 292人参与 | 3人投稿
  •   已结束
  • 看其他人KEGG和GO分析中把一串基因list塞进去,得到一堆值,然后画画图,好像很轻松的样子。然而,本渣在操作的时候,却遇到了了一个基本的问题:放进去的基因list,也就是DEG,是所有的DEG都塞进去,还是分上调的和下调的分
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