需求发布流程
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  • 请教下大家,在GSEA分析时,跳出错误显示As the phenotype choosen was continuous, only continuous class metrics are allow。这一句是什么原因,该如何解决?谢谢了!
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  • 求翻译,生物信息学方面lthough the authors improved the content and quality of the manusc ript, th ANOVA table is not presented yet. Since the authors conducted all experiments three times; this means , you have Experiment and Threatments are the main effects. Therefore, you will have Expe
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  • 请问大家用哪个软件可以做出这种火山图?如何根据差异蛋白fold change来标记不同颜色呢?
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  • 各位大神好,公司已经对转录组数据进行了分析,然而老师要我进行接下来的功能挖掘,我就有点无从下手。请问我需要怎么着手呢?是先看差异基因表达,之后KEGG的注释在找到这个基因通路么?GO的结果注释图怎么看,有点看
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  • 有两个问题:一是在GENCODE的基因注释文件中,我发现有些基因在旧的版本中出现,而在新的版本中被移除了,这是为什么呢?二是有些新版本的基因数比旧版本略少,这是什么原因呢?谢谢!
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  • 怎样用CEGMA评估?
  • 福建省福州市仓山区
  • 10.00
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  •   1天后选稿结束
  • 审稿人提出无参转录组的unigenes小于300bp的太多,让用CEGMA转件评估,请问大家这个需要怎么做?有没有具体的操作流程,谢谢!
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  • 各位大神好,请教下:下图中讲述通过GSEA富集分析后挑选Significant gene sets进行Cytoscape网络可视化,但是Cytoscape的使用需载入sif格式的文件,GSEA得到的结果是图片、总结表格,请问GSEA富集分析如何通过Cytoscape得到图2的图形?谢谢
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  • 最近学习R语言,想利用癌和癌旁的差异基因画热图。目前只会用EXCEL筛选出GEO芯片的上调和下调基因,可是做不出矩阵。学生最近一段时间再网上学习了R语言相关知识,看了一些视频,想利用R语言来做差异基因的矩阵并画出热图
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  • 现有全基因组的SNP位点信息以及QTL位点,但是不知道怎么去筛选和分析SNP,以及利用SNP开发标记去加密,求做过的大神指导!
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  • 最近正在研究RNA测序分析lncRNA和miRNA,初学者好多问题真不太清楚,请问starBase这个数据库,除了研究癌症疾病lncRNA-miRNA的相互作用外,对于其他疾病可以用吗?多谢多谢~~
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  • RNA-seq问题
  • 浙江省杭州市上城区
  • 20.00
  • 诚意金悬赏
  • 97人参与 | 5人投稿
  •   已结束
  • 各位大神好,我最近在做一些RNA-seq数据,链特异性文库,在比对的时候也加了相应的参数。比对之后samtools转换成排序后的bam文件。用Stringtie进行拼接,加了-e参数,即不拼接新的转录本,以及注释文件(gtf)。得到结果后大多数
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  • 查阅很多文献,但是不知道如何编写RNA一级结构,这RNA一级结构需要有一些功能片段。我还查了NCBI,不知道怎么运用这个在线软件查询,希望大神帮帮忙,给点提示。对于NCBI这个最好有个教程。
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  • 我用tcga的mirna数据筛选了几个mirna,做靶基因预测的时候发现了一些问题。比如mir-1-1,mir-1-2这种在targetscan无法预测靶基因,只能预测mir-1的靶基因。请问这种情况应该这么办呢。 那么我分析的时候,这两个mirna需要分开分析还是
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  • 用tcga的mirna数据筛选了几个mirna,做靶基因预测的时候发现了一些问题。比如mir-1-1,mir-1-2这种在targetscan无法预测靶基因,只能预测mir-1的靶基因。请问这种情况应该这么办呢。 那么我分析的时候,这两个mirna需要分开分析还是说
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  • 需求描述:1:将该文件中非ATG开头的序列删去。2:保证每一条序列长度为3的尽可能大的倍数,多余1~2个碱基删除。3:制作如下EXCEL表格(表 I)第一列为序列名,之后64列为64种密码子在该序列中的数量,如没有则为0.(表 II)第
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  • 帮忙设计思路
  • 陕西省西安市临潼区
  • 50.00
  • 诚意金悬赏
  • 248人参与 | 7人投稿
  •   冻结中
  • 如上图,类似的图是用什么软件做出来的呢?ggplot可以画出来吗?如果可以,请大神举个例子给个函数我就行。
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  • genespring使用
  • 广西南宁市上林县
  • 45.00
  • 诚意金悬赏
  • 237人参与 | 3人投稿
  •   冻结中
  • 我在研究一种基因突变所致的疾病,发现了两个新发突变,一个是无义突变(突变为终止密码子),一个是错义突变,已经在NCBI找了突变点在保守结构域,用软件预测了是致病性突变(SFIT等 针对错义突变)查了一些资料,真正确定新发
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  • 求助,就是比如需找NF-kB的靶基因,可以根据一些软件找到能否结合的序列,然后改序列那些基因的转录起始位点的预测可以做么?
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显示 1~20 项 共 63 个需求
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